Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf112Q96DY5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf112Q96DY5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf112Q96DY5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnf112Q96DY5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms