Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf144aQ925F3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf144aQ925F3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms