Protein–RNA interactions for Protein: Q924X6

Lrp8, Low-density lipoprotein receptor-related protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp8Q924X6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp8Q924X6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp8Q924X6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms