Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim7Q923T7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim7Q923T7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms