Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim59Q922Y2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim59Q922Y2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms