Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Prpf3Q922U1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Prpf3Q922U1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms