Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tubb6Q922F4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tubb6Q922F4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms