Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msi2Q920Q6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms