Protein–RNA interactions for Protein: Q920B0

Frmd4b, FERM domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4bQ920B0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Frmd4bQ920B0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Frmd4bQ920B0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms