Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Afg3l1Q920A7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Afg3l1Q920A7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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