Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nek8Q91ZR4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nek8Q91ZR4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms