Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp1bQ91YK2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rrp1bQ91YK2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms