Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bgrl3Q91VW3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms