Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsx1Q91V10 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms