Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apol9aQ8VDU3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms