Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20aQ8VDB9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Slc6a20aQ8VDB9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc6a20aQ8VDB9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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