Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam20bQ8VCS3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20bQ8VCS3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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