Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Med17Q8VCD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Med17Q8VCD5 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms