Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nae1Q8VBW6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms