Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3P9

Slf1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slf1Q8R3P9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slf1Q8R3P9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Slf1Q8R3P9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms