Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdk8Q8R3L8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cdk8Q8R3L8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms