Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CipcQ8R0W1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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