Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Colec12Q8K4Q8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms