Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4B2

Irak3, Interleukin-1 receptor-associated kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak3Q8K4B2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Irak3Q8K4B2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Irak3Q8K4B2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms