Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Casc3Q8K3W3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Casc3Q8K3W3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms