Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rassf9Q8K342 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf9Q8K342 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf9Q8K342 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rassf9Q8K342 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rassf9Q8K342 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms