Protein–RNA interactions for Protein: Q8K214

Scmh1, Polycomb protein SCMH1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scmh1Q8K214 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Scmh1Q8K214 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Scmh1Q8K214 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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