Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Neil3Q8K203 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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