Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr1eQ8K202 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Polr1eQ8K202 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms