Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc47a1Q8K0H1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms