Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms