Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc4a8Q8JZR6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc4a8Q8JZR6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms