Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Znf628Q8CJ78 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Znf628Q8CJ78 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Znf628Q8CJ78 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Znf628Q8CJ78 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Znf628Q8CJ78 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Znf628Q8CJ78 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Znf628Q8CJ78 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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