Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LgsnQ8CIX8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LgsnQ8CIX8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms