Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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SbsnQ8CIT9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SbsnQ8CIT9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms