Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CopaQ8CIE6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CopaQ8CIE6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms