Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ercc8Q8CFD5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ercc8Q8CFD5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ercc8Q8CFD5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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