Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snx8Q8CFD4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms