Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
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Gm9955Q8CEJ8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
Gm9955Q8CEJ8 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Gm9955Q8CEJ8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
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