Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp27Q8CEG8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Usp27Q8CEG8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Usp27Q8CEG8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Usp27Q8CEG8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms