Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc17Q8CE13 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms