Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc63Q8CDV6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc63Q8CDV6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms