Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrc9Q8CDN9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lrrc9Q8CDN9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms