Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bhlhe22Q8C6A8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms