Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc90bQ8C3X2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms