Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ssuh2Q8C3L1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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