Protein–RNA interactions for Protein: Q8C166

Cpne1, Copine-1, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne1Q8C166 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Cpne1Q8C166 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cpne1Q8C166 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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