Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tgif2Q8C0Y1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgif2Q8C0Y1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms