Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms