Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Ccser1Q8C0C4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ccser1Q8C0C4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ccser1Q8C0C4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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